תקנה 3 לתקנות ההסדרים במשק המדינה (תיקוני חקיקה) (הקלות מס בקשר להסדרי הסיוע לחקלאים), התשנ"א- 1990 (להלן: "התקנות") קובעת פטור ממס שבח ומס מכירה במכירת מקרקעין שתמורתה משמשת לכיסוי התחייבויות הנישום במסגרת חוק ההסדרים במגזר החקלאי המשפחתי התשנ"ב – 1992 או "הסכם הקיבוצים" או "הסכם נוסף" והמקרקעין שימשו אותו בייצור הכנסתו בשנים שקדמו לשנת המכירה.

בחוזרנו מס' 6/2006 דיווחנו כי רשות המיסוי שינתה לאחרונה את שיטת תקצור הפטור לפי תקנה 3 והפטור ניתן כאחוז החזר החובות משווי המכירה ברוטו כך שחלק מהניכויים מיוחסים לחלק הפטור ואינם מותרים בניכוי מהשבח. טכניקה זו יצרה סכום החייב במס למרות שכל התמורה האפשרית ממכירת המקרקעין שמשה לכיסוי ההתחייבות.

הבעיה בלטה בעיקר כאשר הייתה שומה בגין מכירת זכות בהרחבה למגורים ולתמורה התווסף סכום בגין הוצאות הפיתוח או עלויות בניה, אשר האגודה או הגורם המפתח, השקיעו בפיתוח הקרקע. שווי הוצאות אלו, כאמור, התווסף לשווי המכירה והותר בניכוי מהשבח לפי אחוז הביצוע בפועל, כך שלפי השיטה החדשה לעולם לא התקבל פטור מלא בגין מכירת הקרקע לכיסוי התחייבויות.

כתוצאה מעמדת רשות המסים כמוצג לעיל האגודות אשר מכרו זכויותיהן בקרקע ונותרו ללא תמורה, עדיין היו חייבות מס שבח ומס מכירה בשל ניכויים שלא הותרו.

בעקבות פנייתו של מר חיים בהומי מנכ"ל המנהלה להסדרים במגזר החקלאי המשפחתי לרשות המיסים סוכם כי יינתן פטור מלא ממס על תמורה שהועברה לכיסוי חובות באם סכום הוצאות הפיתוח שנגבו מרוכשי המגרשים בהרחבה הוצא במלואו לפיתוח שטח ההרחבה ולא לשדרוג היישוב הישן.

בהתקיים התנאי שלעיל יותרו הוצאות הפיתוח במלואן בחישוב שבח המקרקעין הכולל את הוצאות הפיתוח כרכיב בתמורה.

יתרת התמורה שהועברה לכיסוי חובות על פי אישור המנהלה להסדרים במגזר החקלאי המשפחתי תהא פטורה במלואה ממס שבח וממס מכירה.

לפרטים ולהבהרות ניתן לפנות לרו"ח חן שחרור או לעו"ד שרון בכר במשרדנו בת"א.