סעיף 61 לפקודת מס הכנסה מסמיך את נציב מס הכנסה להורות כי הוראת סימן א' לפקודת מס הכנסה יופעלו על מושבים שיתופיים, דהיינו שיטת חישוב המס הנהוגה בקיבוץ תיושם גם במושב שיתופי וזאת בהתקיים שני תנאים מצטברים:

(1) מדובר באגודה שיתופית להתיישבות חקלאית.

(2) הוכח להנחת דעתו של פקיד השומה שדרכי הנהלת העסקים במושב השיתופי דומות באופיין לאלו הנהוגות בקיבוץ. (הדגשה שלי – ב.מ.)

ע"פ הוראת קיבוץ הפרשנות לפקודת מס הכנסה (חבק מס הכנסה) בפרשנות לסעיף 61 לפקודת מס הכנסה נקבע:

"בשל אופי פעילותו של המושב השיתופי דומה הוא במהותו לזה של הקיבוץ, כפי שעולה מההגדרות. גם במושב שיתופי הבעלות על אמצעי הייצור, השיווק והקניין הציבורי היא בידי האגודה. כמו כן, קיים שיתוף בשטחי הייצור, החינוך והשוויון בצריכה. לפיכך, הפעיל הנציב את סמכותו וקבע - כי לגבי "מושב שיתופי" יחולו ההוראות החלות על הקיבוץ. נובע מכך, כי יש לקבוע את הכנסת המושב השיתופי כדרך שקובעים את הכנסת הקיבוץ. כמו כן, חישוב המס לגבי המושב השיתופי יהא בדרך שבה מחושב המס בקיבוץ - בהתאם להוראות בסעיפים 54 - 58."

דהיינו, עפ"י קובץ הפרשנות, קבע הנציב כי אופי הפעילות במושב שיתופי דומה במהותו לאופי הפעילות בקיבוץ ולכן יש להחיל את הוראת סעיף 61 לפקודה גם על מושב שיתופי.

נושא השינויים במושבים השיתופיים נדון בעבר ואף התקבלה החלטה ע"י גב' מיכל אייזנשטט, מפקחת ארצית קיבוצים בעבר מיום 6/4/92 ובאישורו של סגן נציב מס הכנסה דאז רו"ח זאב פלדמן ובו נקבע מפורשות כי הוראות סעיף 61 ימשיכו לחול על המושב השיתופי גם אם חבריו עובדים בחוץ וכל משכורתם מתקבלת על ידם . (ראו חוזרנו 16/92)

להלן ציטוט ממכתב נציבות מס הכנסה מיום 6.4.92:

"עבודת חברים מחוץ למושב

במקרים בהם חברים יוצאים לעבוד מחוץ למושב, והכנסות כל החברים העובדים בחוץ נרשמות במלואן בספרי המושב ומדווחות על ידו ימשיכו לחול הוראות סעיף 61 לפקודה"

מאחר ומרבית המושבים השיתופיים והקיבוצים נמצאים בעיצומו של תהליך משברי (כלכלי וחברתי) שבסיומו צפויים שנויים מהותיים , הועברה פנייה לנציב מס הכנסה לפיה יחולו ההוראות הנוכחיות עד 31.12.01 ובמהלך השנה הקרובה יבחנו במשותף עם נציגי המושבים השיתופים והקיבוצים שיטות מיסוי מתאימות.