במכירה או ברכישה של נחלה במשק חקלאי עולה סוגיית החבות במע"מ לעניין חישוב דמי ההסכמה.
בחישוב דמי ההסכמה מינהל מקרקעי ישראל (להלן - ממ"י) אינו גובה דמי הסכמה בגין רכיב המע"מ אולם ממ"י מבקש הוכחה לכך שאכן המע"מ שולם או שאין חבות במע"מ.
להלן התייחסותו לרכיב המע"מ בחישוב דמי הסכמה במצבים שונים:
א. כאשר בהסכם המכר נקבע שמע"מ יחול על הקונה או שעל התמורה ישולם מע"מ כחוק -
השווי לעניין חישוב דמי הסכמה יקבע על פי התמורה בהסכם בתנאי שיומצא אחד מהמסמכים הבאים:
1. המוכר ימציא חשבונית מס שהוצאה בגין מכירת הנחלה. (החשבונית יכולה לצאת ע"י המוכר או ע"י האגודה בתיק איחוד העוסקים).
2. תומצא חשבונית מס של הקונה (במקום המוכר) בגין רכישת הנחלה.
3. יומצא אישור האגודה לפיו הקונה צורף לאיחוד העוסקים של האגודה עם חבריה.
ב. במקרים בהם נאמר בהסכם המכר שמע"מ אם יחול ישולם על ידי הקונה -
ממ"י מוסיף לשווי התמורה את מלוא המע"מ בגין הנחלה זאת למרות שגם אם היה חל מע"מ רק חלק מהתמורה היה חייב במע"מ.
על מנת שלא יתווסף המע"מ מפנה ממ"י את המוכר למשרדי מע"מ להמצאת אישור שאין חבות במע"מ. מוכר שיפנה למשרדי מע"מ עלול להיתקל בקושי לקבלת האישור הנדרש מאחר שלא קיים במע"מ הליך של המצאת אישור על אי חבות במע"מ.
לפתרון הבעיה פנינו לממ"י שיקבע השווי לעניין חישוב דמי הסכמה על פי התמורה בהסכם (ללא תוספת מע"מ) באם תומצא חוו"ד רו"ח הקובעת שאין חבות במע"מ במכירת הנחלה.
ג. בהסכם המכר אין כל התייחסות למע"מ -
השווי לעניין חישוב דמי הסכמה יקבע על פי התמורה בהסכם.