בעקבות פניה של משרד החקלאות ופיתוח הכפר לרשות המיסים הובהר על ידי רשות המיסים כי "על התמיכה בגין הקיצוץ בהקצאת המים לשנת 2009 לא יחול חיוב במע"מ".

נציין כי בעבר ניתן אישור דומה על ידי הנהלת מע"מ אשר התייחס לפיצוי קיצוץ מכסות המים בשנת 1991 כדלקמן:

"פיצוי המשולם לעוסק בעבור קיצוץ במכסות מים איננו בבחינת "עסקה" (תרומה תמיכה או סיוע כאמור בסעיף 12 לחוק) כהגדרתה בחוק מס ערך מוסף, התשל"ו – 1975.

לפיכך מקבל הפיצוי (עוסק) לא חייב במע"מ בגין קבלת הפיצוי".

נדגיש כי עדיין נותר להסדיר חבות מע"מ ביחס לתמיכות ומענקים הניתנים מתקציב משרד החקלאות אשר הטלת מע"מ עליהם, עפ"י המצב החוקי הקיים, עלולה להכשיל את מדינת העידוד של הממשלה מאחר ותקציבם אשר סוכם עם משרד האוצר לא כולל מע"מ.